Expozice Prácheňského muzea byly otevřeny 18. května 1993. Autory scénérií jsou z velké části odborní pracovníci muzea, další části zpracovali přizvaní odborníci, např. PhDr. Tomáš Durdík, DrSc., PhDr. Jaroslav Kudrnáč, CSc., RNDr. Jiří Machart, CSc., PhDr. František Šmahel, CSc. a Mgr. Ondřej Kolář. Architektonické řešení a koncepce je dílem ing. arch. Vladimíra Boučka, grafické řešení Radomíra Postla a expozice realizovali pracovníci Art Centra České Budějovice. Ve výstavbě je ještě expozice etnografie a barokního umění. Každý sál je doplněn figurínou, která charakterizuje pojednané období. V prostoru mezi prvním a druhým patrem je umístěn hodinový stroj z roku 1768, který pravidelně odbíjí čtvrtky, půlky i celé hodiny a oživuje tak návštěvníkům pobyt v muzeu. Za nově pojaté expozice získalo v roce 1996 muzeum od Rady Evropy cenu Evropské muzeum roku.