Muzeum ve své výstavní síni (Galerie synagoga), která se nachází na ulici Novosady 1146/79, pořádá pravidelné krátkodobé výstavy. K vidění je zde též stálá expozice „Magen David", která mapuje historii Židů ve Velkém Meziříčí.
Naše muzeum shromažďuje, spravuje, odborně využívá a zpřístupňuje sbírky převážně regionálního charakteru (přírodovědné a historické). Menší část tvoří oddělení pozemních komunikací.